本发明公开了一种聚硅氧烷包覆聚酰亚胺核壳微球及其制备方法。其制备方法是在惰性气体保护下，将环氧基聚硅氧烷微球加入到二胺和N,N‑二甲基乙酰胺组成的澄清透明溶液中；在温度为80～100℃的搅拌条件下反应，结束后降温至15～25℃，加入均苯四甲酸酐,再经过滤、甲醇洗涤，将得到的粗产物进行热酰亚胺化反应，得到一种聚硅氧烷包覆聚酰亚胺核壳微球。该核壳微球具有突出的热稳定性，且表面带有‑NH2。提供的制备方法具有原料来源广、工艺简单可控等优点；并可通过控制反应参数，调节核的内径与核壳微球的粒径；通过控制均苯四甲酸酐的加入方式与频率，可在聚硅氧烷微球表面生成聚酰亚胺壳，提高核壳微球的制备的产率。