本发明公开了一种Nafion/氨基酸修饰空心介孔硅杂化膜，是由Nafion与氨基酸修饰空心介孔硅构成。其制备过程包括：合成二氧化硅微球，利用二氧化硅微球，通过双层化、去核及去模板制得空心介孔硅；将空心介孔硅与3‑氨丙基三乙氧基硅烷进行反应，得氨基修饰的空心介孔硅；将氨基修饰的空心介孔硅与氨基酸在EDC和NHS的缩合作用下制备氨基酸修饰空心介孔硅；氨基酸修饰空心介孔硅与Nafion溶液共混得铸膜液，经流延法制得该杂化膜。本发明杂化膜的制备过程绿色环保、可控性强，制得的Nafion/氨基酸修饰空心介孔硅杂化膜应用于直接甲醇燃料电池，具有较高的质子传导率和良好的阻醇性能。