本发明公开了橡胶相具有核壳结构的氟硅热塑性弹性体及其制备方法。该氟硅热塑性弹性体以硅橡胶为核，氟橡胶为壳，硅橡胶与氟橡胶为具有核壳结构的橡胶粒子分散在氟塑料中；按质量分数计，其原料配方组成包括氟塑料、氟橡胶、硅橡胶、吸酸剂、界面改性剂、硅橡胶交联剂、硅橡胶交联助剂、氟橡胶交联剂和氟橡胶交联助剂；通过动态硫化技术选择性交联橡胶成分获得硅橡胶为核，氟橡胶为壳的核壳结构橡胶颗粒分散在氟塑料基体中。本发明制得的橡胶相具有核壳结构的氟硅热塑性弹性体兼具热塑性塑料的反复加工性，该材料避免硅橡胶与氟塑料直接接触，氟橡胶与氟塑料相容性好，成型加工性能好，综合性能优异。