一种抗菌耐磨纳米复合涂层及其制备方法涉及纳米复合涂层制备领域。一种具备自动杀菌功能，硬度高耐磨损的纳米复合涂层MeCuN，采用物理气相沉积技术(包括磁控溅射和电弧离子镀)在要求具备抗菌功能的工件表面沉积MeCuN涂层，该涂层表面分布有纳米尺度的Cu颗粒，利用纳米Cu颗粒表面自由能高，比表面积大的特点，不需杀菌材料及太阳光等额外条件，能够自动杀灭工件表面超过99％以上的细菌。该涂层以硬质氮化物陶瓷涂层为基，因此具有很高的硬度，具有较高的耐磨损性能，可以用在需要长时间杀菌的场合，如手术刀等医疗器械，洗菜盆等厨房用具，不锈钢扶手等公共交通工具。该涂层厚度约几个微米，因此不改变工件的尺寸，可用于精密设备的表面抗菌处理。