本发明提供一种基于空轨两用无人机的高速铁路安全检测系统，该系统包括无人机、远程监控中心、地面站、无线通信模块。无人机包括提供空中飞行动力的旋转叶片和提供沿轨道行驶动力的推动螺旋桨，地面站用于设置无人机的飞行路线以及控制无人机的空中飞行模式和轨道航行模式，远程监控中心用于监控无人机的飞行状态，分析检测信息，以及无人机行驶过程中出现意外情况时进行应急响应。本发明采用无人机的空中飞行和沿铁轨运行两种巡检方式，两种工作模式可根据现场需求灵活搭配安排、随时切换，突破解决了传统地面巡检模式的高成本、灵活性差、占用正常行车空间等显著问题。