本发明属于智能交通领域，具体涉及考虑客流波动及方案衔接性的周末列车开行方案建模方法。所述方法建立了针对周末客流高峰时期的周末列车开行方案模型，目标函数为列车运行总成本最小，总成本由周末方案线的运行成本与平日方案线的运行成本构成。其中，列车成本由固定成本、停站成本、动车组运用成本构成，为了控制列车方案调整手段的顺序，对列车在站重联解编(调整为灵活编组的列车方案线)和处于周末备选列车集合的方案线赋予相应罚值，利用目标函数约束列车方案线的调整手段顺序。本发明所述方法重组运输资源供给，以高效提升运输产品质量，满足客流需求多样性，充分利用运输资源，实现运输组织的提质增效。