本发明公开了一种生物活性可降解杂化微球的制备方法，包括以下步骤：(1)将粘结剂溶于离子水中，配成粘结剂溶液；(2)将赋形剂溶于离子水中，配成赋形剂溶液；(3)将粘结剂溶液和赋形剂溶液混合，得到粘结剂/赋形剂溶液；(4)在磷酸钙骨水泥中加入可降解高分子微球和硅酸钙粉体，得到混合粉料；(5)将粘结剂/赋形剂溶液和混合粉料充分混和，制得均匀的浆料，将浆料滴到液氮中；对收集到的杂化微球进行养护、真空干燥，得到生物活性可降解杂化微球。本发明还公开了上述杂化微球的应用。本发明的制备方法简单、可实现工业化生产，制得孔隙率高、连通性好、可作为骨缺损填充修复和药物载体材料的生物活性可降解杂化微球材料。