本发明公开了一种主客体超分子水凝胶及其制备方法与应用，所述主客体超分子水凝胶由主客体超分子和甲基丙烯酸酐化的明胶(GelMA)在紫外光(UV)条件下引发自由基共聚制备而成，具有良好的力学强度和生物相容性。主客体超分子由经丙烯酸异氰基乙酯改性的β‑环糊精(β‑CD)和丙烯化的1‑溴代金刚烷通过主客体偶合作用制备而成。对比纯GelMA水凝胶，主客体超分子水凝胶展现了良好的力学性能，通过调节主客体超分子的浓度可以控制水凝胶的力学强度，同时具备良好的生物相容性。本发明制备过程简单，条件温和，力学强度有效提高，在组织修复工程领域有良好的应用前景。